在臺灣，比較特殊的是犬隻的近親交配問題。犬隻不似人類有倫理關係，因
此會產生諸如姊弟、兄妹、母子、父女....種種交配。近親交配所生下的犬隻，
優質基因或劣質基因出現的比例都比較高，但是有些人小本經營，養了一、兩隻
純種的公狗，就想繁殖小狗賺錢，便讓公狗和牠的直系血親母狗不斷交配，越交
配到後來，劣質基因出現的可能性越高。
    劣質基因出現時，我們通常會看到什麼呢？主要是畸形，器官構造上的畸形
，如顎裂（兔唇）、頭蓋骨發育不全（腦門在長大後關不起來）、侏儒（永遠長
不大養不大的石頭狗）、被毛品質變異（譬如馬爾濟斯的長毛變成短捲毛、貴賓
狗的綣毛直立濃密變成倒下稀疏），有的狗骨骼發育特別不全，譬如脾臼窩淺（
大腿骨和骨盆腔之間的髖股關節），很容易脫臼，以及X型腿及O型腿，或是小型
犬的膝蓋關節脫位....。